1、鹽解：將刮好的新鮮腸粘膜，每 100 斤腸粘膜加入清水 100 斤，按腸粘膜和水的總重量，加入 4%的 工業鹽，攪拌均勻，再加燒堿液調 PH 值為 8--9，緩慢升溫 50--55 度，加溫時每 10--20 分鐘加水攪拌一次，恒溫 2 小時，注意要間隔攪拌。恒溫結束后，要快速升溫到 96--98 度，恒溫 10 分鐘，趁熱撈出 上層的渣子。用 100 目尼龍布過濾。 注意加鹽過多會使下一步交換吸附含量超過規定，加鹽過少，肝素和蛋白質分離不*，堿性過強，會使肝素 降解破壞，收率下降。同時還能使一些蛋白質溶解度增大，造成過濾困難。堿性不足造成提取液偏酸，則 在高溫的情況下，肝素迅速破壞，升溫過急會使蛋白質早凝固，影響肝素的分解和溶出。
2、吸附：待提取液溫度冷至 50--55 度，應檢測鹽濃度為 3。5--5%時，即可加入 5%已處理號的樹脂。 如樹脂上含有鹽水，需用清水將樹脂洗凈控干，方可使用。攪拌吸附 6--8 小時，轉速 60--80 轉/分鐘為 宜，攪拌須使樹脂上下翻動，否則吸附效果差，收率低。吸附完畢，棄去上層吸附液，然后用 100 目的尼 龍布過濾出樹脂。 加入提取液的樹脂量： 新樹脂可按提取液的 5--6%加入， 舊樹脂可按提取液的 8--10％。
3、洗滌：過濾后的樹脂用 40 度左右的溫水，漂洗干凈。再放入與樹脂重量相等的鹽溶液中（鹽溶液的濃 度為 5%左右）洗滌 10--20 分鐘，除去低分子肝素和一些蛋白質，然后將樹脂過濾。
4、洗脫：*次洗脫將過濾號的樹脂放入濃度為 20--22%的鹽溶液中攪拌洗脫 5--6 小時，樹脂和鹽水 的比例為 1：0。7。過濾后將樹脂控干進行第二次洗脫，調鹽溶液濃度為 16--18%，攪拌 3 小時以上， 樹脂和鹽水的比例與*次相同，過濾后的水即是藥液。
5、除雜：將稀堿水加入洗脫后的藥液里，要快攪慢加，調 PH 值為 10--12 攪拌 2 分鐘，靜止沉淀 20 小 時后，抽出上層藥液，下沉的是雜質，且渣子放另外桶內過濾。過濾后的藥液和下次藥液除雜時合并待用。
6、沉淀：將抽出除雜 后的藥液加入鹽酸調 PH 值為 7--7。5，即可加入酒精進行沉淀。向藥液里加入酒精 要快攪慢加。（由于酒精的濃度不同，因此沉淀肝素的酒精用量不等）用酒精計測量酒精度為 30--35%， 加蓋密封，沉淀 20 小時。棄去廢酒精收集糊狀肝素。注意在抽出廢酒精時，不可抽動沉淀的肝素。將多 次的肝素鈉漿收集在一起，以備集中脫水干燥。
7、脫水：將的肝素鈉漿，用雙層的確良布過濾后放入 95%的酒精內浸泡 20 小時，加蓋密封。過濾 后按上述方法重復一次，使其充分的將肝素上的水分交換下來。
8、干燥：待肝素鈉漿瀝干后，放在不銹鋼盤中烘干，用鏟子來回的翻動，溫度保持在 50--55 度，注意溫 度低于要求是不易烘干的，溫度高于 60 度時會使肝素鈉的生物活性下降。干燥后的肝素很易吸潮，應及 時用雙層塑料袋密封包裝，于通風干燥處存放。