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          PCR反應所需細菌DNA 模板的制備

          點擊次數:1302 更新時間:2012-08-28
           

          PCR反應所需細菌DNA 模板的制備

          從分析的標本中純化核酸,即制備PCR反應的模板,是使PCR獲得成功的重要的*步。由于PCR的用途各異,用于抽提核酸的起始材料種類可能差異很大(包括新鮮的、儲存的和古代的)。每種特殊樣品類型有各自的限制和抽提核酸的不同要求,但它們都有一個共同的標準,擴增的靈敏性要求特別注意不同材料、PCR產物、質粒或對照之間可能存在的交叉污染。由于PCR不需要高分子量和高度純化的核酸,為zui大限度材料污染的機會,可以使用快速而且簡便的提取方法。

          【試劑與配制】

          TE緩沖液(pH8.0)

          裂解緩沖液:2%SDS,10μg/ml蛋白酶K溶于TE中。

          RNase A (10mg/ml)

          平衡酚

          :(24:1)

          無水乙醇

          70% 乙醇

          3mol/L 乙酸鈉(pH5.2)

          【操作方法】

          1、方法一

          (1)從平板上挑取至少1.5mm的菌落到一微量離心管中,加入400μl裂解緩沖液,混勻;

          (2)55℃~60℃,水浴15~20min;

          (3)加入等體積的酚::(25:24:1),混勻;

          (4)5000g離心10min;

          (5)吸取上層水相,再加入等體積的:(24:1);

          (6)重復(3)~(4);

          (7)吸取上層水相,加1/10體積3mol乙酸鈉及RNase A(終濃度為0.25~0.3μg/μl),輕搖,37℃保溫30 min;

          (8)加入2.5倍體積的預冷無水乙醇,-20℃ 2hr;

          (9)10,000g 離心15min,棄上清,或用無菌細玻棒攪纏出DNA;

          (10)70% 乙醇洗2次,待乙醇蒸干后重新溶于小體積去離子水或TE緩沖液中(約20μl)。一次取5~10μl進行PCR反應。

          2、方法二

          (1) 取一定數量的細菌加入500μlTE緩沖液中;

          (2) 100℃煮沸10min,置冰浴保存;

          (3) 10,000rpm,4℃離心10min;

          (4) 取適量上清作為PCR 模板。

          3、方法三

          (1) 制備一定濃度的細菌/去離子水懸液,反復凍融3次;

          (2) 10,000rpm,4℃離心10min;

          (3) 取適量上清作為PCR 模板。

           
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